油棕乙酰CoA羧化酶(ACC)基因的鉴定与表达分析

• 作者: 夏薇 曹红星 王永 石鹏 肖勇 金龙飞 雷新涛
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 油棕 ACC基因 转录组 RPKM
• 年，卷（期）: 2017,（31）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 154-155,159
• 页数: 3页
• 分类号: S188
• 字数: 2354字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2017.31.049

摘要

[目的]对油棕乙酰CoA羧化酶(ACC)基因进行鉴定与表达分析.[方法]采用生物信息学方法鉴定油棕的ACC基因,并应用拟南芥的ACC基因蛋白质序列比对油棕的蛋白质库,应用已有油棕转录组信息,研究ACC基因在不同组织中的表达情况.[结果]在油棕中鉴定了2个ACC基因,命名为EgACC1和EgACC2.EgACC1不舍内含子,而EgACC2含有32个内含子;EgACC1在不同组织中都没有表达,而EgACC2在所有组织中都有表达,其中在组培苗中有较高的表达量,同时,在油棕果发育21 d时有高的表达水平,RPKM值为70.6,为所有组织中最高.[结论]该研究阐述了油棕ACC基因的表达模式,为油棕ACC基因的功能分析奠定了基础.