Affymetrix基因表达谱芯片在新疆维吾尔族与汉族胰腺癌组织样本间差异表达基因筛选中的运用

• 作者: 丁伟 依马木买买提江·阿布拉 张波 易超 李海军 苏雅婷
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 医学
• 关键词: 胰腺导管细胞癌 Affymetrix基因表达谱芯片 基因差异表达 基因本体分析 通路分析 维吾尔族
• 年，卷（期）: 2017,（32）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 6215-6223
• 页数: 9页
• 分类号: R-33|R735.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.13241/j.cnki.pmb.2017.32.003

摘要

目的:运用基因表达谱芯片筛选并分析新疆维吾尔族与汉族胰腺癌组织样本间的差异表达基因.方法:收集我院2014年1月至2016年6月间行手术切除的维吾尔族与汉族胰腺导管细胞癌组织并提取总RNA,选取经Nanodrop 2000与Agilent 2100仪器质检合格的样本总RNA采用Affymetrix基因表达谱芯片筛选出差异表达基因并绘制统计图,运用基因本体(Go)分析及信号通(Pathway)分析对这些差异表达基因的生物信息进行汇总分析.结果:通过基因表达谱芯片分析,新疆维吾尔族与汉族胰腺癌组织样本间共检测到1063个基因存在差异表达,在维吾尔族胰腺癌标本中显著上调表达的基因共281个,差异表达倍数最高的为IGLV1-44基因(差异倍数:9.99)下调表达的基因共782个,差异表达倍数最高的为CPB1基因(差异倍数:33.76);在Gene Ontology数据库中共检索到815个上述差异表达基因具有明确的GO分类,差异表达倍数最高的为CPB1基因(差异倍数:33.76);Pathway分析中共检测到30条信号通路包含有上述差异表达基因,共涉及196个基因,其中以FAK信号通路差异表达基因富集程度最高,差异表达倍数最高的基因为COL11A1基因(差异倍数:5.02).结论:基因表达谱芯片分析结果显示,在新疆维吾尔族与汉族胰腺癌组织样本间存在大量的差异表达基因,这些基因与胰腺癌的增殖分化、侵袭转移及多药耐药等特性密切相关,且参与了多条生物体内重要信号转导通路的调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丁伟	新疆医科大学附属第三医院肝胆外科	39	192	7.0	12.0
2	依马木买买提江·阿布拉	新疆医科大学附属第三医院肝胆外科	12	39	3.0	5.0
3	易超	新疆医科大学附属第三医院肝胆外科	18	74	4.0	8.0
4	苏雅婷	新疆医科大学附属第五医院医务部	7	16	2.0	3.0
5	张波	深圳市罗湖区人民医院普外科	3	3	1.0	1.0
6	李海军	深圳市罗湖区人民医院普外科	3	3	1.0	1.0