沙田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因的鉴定及序列分析

• 作者: 刘玉洁 张渝 李惠敏 秦新民 覃信梅 郭丹妮
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 沙田柚 GDSL酯酶/脂肪酶基因 序列分析 鉴定
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 45-48
• 页数: 4页
• 分类号: S666.301
• 字数: 3435字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2017.11.012

摘要

利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序.通过差异分析得到GDSL酯酶/脂肪酶的基因序列,该基因全长1 306 bp(GenBank登录号:KU159279),开放阅读框(简称ORF)全长1 104bp,共编码367个氨基酸,编码的蛋白质分子量为40.09 ku,理论等电点为6.44,含有1个与SGNH蛋白相同的保守结构域(conserved active sites,简称CAS);GDSL基因在沙田柚自交1d花柱中的表达量(简称RPKM)为4.68,2d为2.41,3d则迅速下降到0.27;在异交1d花柱中该基因的表达量为4.48,2d迅速升高至7.43,3d仍维持较高水平为4.37;系统进化树显示,沙田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因与甜橙(Citrus sinensis)亲缘关系很近,属于同一进化分支.