泛癌症DNA甲基化位点聚类分析

• 作者: 张军英 杨利英 杨胜楠 耿芳歌 袁细国
• 来源期刊: 西安电子科技大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 模式识别 脱氧核糖核苷酸甲基化 差异位点 聚类分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 页码范围: 23-28
• 页数: 6页
• 分类号: TP181
• 字数: 5109字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-2400.2018.04.005

摘要

当前对脱氧核糖核苷酸甲基化的研究大多局限在单一疾病中单个基因或者某个较小的区域.针对这一局限,提出了一种基于聚类的甲基化分析方法,从泛癌症角度、在全基因组水平上挖掘甲基化模式.首先对多种癌症进行差异甲基化位点筛选;然后对差异甲基化位点进行聚类;最后进行生物富集分析.在泛癌症项目提供的6种癌症上进行了实验研究,通过筛选得到2184个差异甲基化位点,通过聚类得到9个甲基化簇.在甲基化簇中进行的模式分析结果显示,不同类型的癌症在甲基化模式上存在共性,甲基化和基因表达之间关系较为复杂,不是单纯的正负相关关系.富集分析结果表明,该项研究得到的基因集合在多个癌症的通路中存在显著富集.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张军英	西安电子科技大学计算机学院	113	2001	25.0	41.0
2	杨利英	西安电子科技大学计算机学院	8	19	3.0	3.0
3	袁细国	西安电子科技大学计算机学院	7	16	3.0	3.0
4	杨胜楠	西安电子科技大学计算机学院	1	4	1.0	1.0
5	耿芳歌	西安电子科技大学计算机学院	1	4	1.0	1.0