克山病病区自产玉米霉变真菌多样性初步检测报告

• 作者: 冀涛 冯红旗 孙树秋 张娟妞 张敏 李君钒 邵建赟 陈凤
• 来源期刊: 中华地方病学杂志
• 关键词: 克山病 真菌,霉菌 序列分析,DNA
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 351-356
• 页数: 6页
• 字数: 5638字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.2095-4255.2018.05.002

摘要

目的 检测克山病病区霉变玉米真菌谱带,获得其中优势菌群的信息,为后续次生毒素研究提供依据.方法 在克山病病区(甘肃省庆阳市合水县、正宁县,黑龙江省尚志市元宝镇)及非病区(黑龙江省哈尔滨市郊区)4个采样点,每个采样点采用简单随机抽样的方法采集当地种植的新脱粒玉米样品5份,共20份,置于无菌自封袋内密封、编号并运回实验室.放置于真菌培养箱内,霉焐培养2周后,进行真菌总DNA的提取.然后将DNA样品送至北京奥维森基因科技有限公司进行质检,并利用高通量DNA测序技术及MiSeq PE3000平台对真菌内转录间隔区1(ITS1)进行测序分析,通过稀释性曲线及香农曲线是否趋于平缓分析测序数据量的合理性,通过物种组成覆盖率(Coverage)是否＞99％分析测试样品中真菌群落的真实情况,根据真菌物种在各组中的相对丰度寻找病区组与非病区组之间的差异菌属.结果 高通量DNA测序分析共获得513 869条优质序列,共产生528个操作分类单元(OTU).稀释性曲线及香农曲线的趋势是逐渐趋于平缓的,表明本次测序数据量合理;Coverage值均＞99％,表明测序结果能反映样品中真菌群落的真实情况.物种组成分析表明,克山病病区和非病区间真菌种类组成有很多重叠,但Wickerhamomyces属、念珠菌属和曲霉菌属相对丰度在病区组高于非病区组.结论 Wickerhamomyces属、念珠菌属、曲霉菌属是3个病区组中的优势菌,可能与克山病发病有关,可考虑用于后续次生毒素的研究.