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一种简单的gRNA体外筛选方法
一种简单的gRNA体外筛选方法
作者:
于清清
刘恩岐
刘懿
徐丽然
成大欣
王晓靖
赵四海
高守翠
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
引导核糖核酸(gRNA)
体外筛选
基因编辑
摘要:
目的 探讨体外筛选效率较高的引导核糖核酸(guide ribonucleic acid,gRNA)的方法.方法 以家兔扭转蛋白2A(torsin family 2 member A,TOR2A)基因的gRNA设计和筛选为例,介绍gRNA简单的体外筛选方法.首先根据TOR2A基因的外显子序列在线设计gRNA,选择3条gRNA序列(也可更多),将其分别插入到T7启动子之后,体外转录gRNA并纯化备用.设计包含gRNA打靶序列的一对引物,以基因组DNA为模板进行PCR扩增并胶回收PCR产物.将gRNA,PCR产物和Cas9内切酶组成的体系进行酶切实验,琼脂糖电泳判定gRNA引导的酶切效率.结果 琼脂糖凝胶电泳结果显示第1条gRNA未能引导Cas9内切酶对含打靶位点的PCR产物进行DNA酶切,第2条gRNA(GCTTGTCCATCTCGTCGAAG)和第3条gRNA(TCTCTTCCTCTTCGACGAGA)引导Cas9进行了比较彻底的酶切,第2、3条gRNA可用于后续研究.结论 此体外筛选方法是一种简单、可行和实用的gRNA的体外筛选策略.
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篇名
一种简单的gRNA体外筛选方法
来源期刊
实验动物与比较医学
学科
生物学
关键词
引导核糖核酸(gRNA)
体外筛选
基因编辑
年,卷(期)
2018,(2)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
126-129
页数
4页
分类号
Q95-33
字数
2527字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-5817.2018.02.009
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
成大欣
陕西省人民医院新生儿科
7
40
4.0
6.0
5
徐丽然
陕西省人民医院新生儿科
1
2
1.0
1.0
6
于清清
陕西省人民医院新生儿科
1
2
1.0
1.0
7
高守翠
陕西省人民医院新生儿科
1
2
1.0
1.0
8
王晓靖
陕西省人民医院新生儿科
1
2
1.0
1.0
9
刘懿
陕西省人民医院新生儿科
1
2
1.0
1.0
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刘恩岐
陕西省人民医院新生儿科
1
2
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陕西省人民医院新生儿科
1
2
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研究来源
研究分支
研究去脉
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实验动物与比较医学
主办单位:
上海市实验动物学会
上海实验动物研究中心
出版周期:
双月刊
ISSN:
1674-5817
CN:
31-1954/Q
开本:
16开
出版地:
上海浦东金科路3577号
邮发代号:
4-789
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
2226
总下载数(次)
11
总被引数(次)
7271
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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