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摘要:
目的 利用药效团和分子对接等模拟方法,基于过氧化物酶体增殖物激活型受体 γ (PPARγ)-肝X受体α(LXRα)-三磷酸腺苷结合盒转运体Al(ABCA1)通路发现中药中具有降脂作用的潜在活性化合物.方法 首先,选择PPARγ和LXRα作为研究载体,分别构建其激动剂的药效辨识模型.通过对药效团模型的验证与评价,获得PPARγ和LXRα的最优药效团模型.随后,利用最优药效团模型筛选中药化学成分数据库(TCMD),结合Lipinski五规则及化合物与药效团模型的匹配度,得到初筛化合物.最后,利用分子对接方法进一步精简筛选结果,保留对接打分值较高的化合物,并分析其关键氨基酸,分别得到PPARγ和LXRα的潜在激动剂.结果 本研究构建了PPARγ激动剂的最优药效团模型,包括1个氢键受体、1个疏水基团和2个芳香基团;LXRα的最优药效团模型,包括2个氢键受体、1个疏水基团和2个芳香基团.同时利用分子对接方法构建PPARγ和LXRα的蛋白三维模型,并将其用于分子对接研究.结合药效团及Lipinski五规则的筛选结果,分别获得20个和180个初筛化合物.依据筛选标准(打分值和关键氨基酸),最终确定鹰爪木脂醇和桧双黄酮为PPARγ的潜在激动剂,栝楼酯碱和刘寄奴酰胺为LXRα的潜在激动剂.筛选得到的PPARγ和LXRα潜在激动剂可以通过分别作用于PPARγ-LXRα-ABCA1通路上的对应靶标协同发挥降脂作用.结论 本研究高效、快速的筛选了TCMD中具有潜在活性的PPARγ和LXRα激动剂,用于协同上调ABCA1的表达,为高脂血症的药物研发提供先导化合物.
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文献信息
篇名 基于PPARγ-LXRα-ABCA1通路的中药降脂成分研究
来源期刊 北京中医药大学学报 学科 医学
关键词 PPARγ-LXRα-ABCA1通路 药效团 分子对接 虚拟筛选 中药
年,卷(期) 2018,(2) 所属期刊栏目 中药化学
研究方向 页码范围 131-139
页数 9页 分类号 R284.1
字数 4868字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1006-2157.2018.02.007
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张燕玲 北京中医药大学中药学院 90 652 14.0 20.0
2 赵博文 北京中医药大学中药学院 5 12 3.0 3.0
3 谷宇 北京中医药大学中药学院 6 18 3.0 3.0
4 陈艳昆 北京中医药大学中药学院 4 7 2.0 2.0
5 张栩 北京中医药大学中药学院 4 6 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
PPARγ-LXRα-ABCA1通路
药效团
分子对接
虚拟筛选
中药
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北京中医药大学学报
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1006-2157
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大16开
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