棉花GhFAD2-1基因5'UTR内含子的克隆与序列分析

• 作者: 刘峰 孙亮 孙杰 张新宇 文凤
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 GhFAD2-1基因 5'UTR内含子 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: S562|S188
• 字数: 5345字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2018.01.001

摘要

[目的]对棉花 Δ12-油酸去饱和酶基因GhFAD2-15'UTR区的内含子进行克隆和序列分析,为研究GhF AD2-1的表达调控奠定基础.[方法]利用5'RACE 技术,克隆GhFAD2-1的5'UTR序列,结合棉花基因组序列,克隆G hFAD2-15'UTR内含子,并利用PLACE等生物信息学软件对其顺式作用原件进行分析.[结果]棉花 A、D基因组的G hFAD2-15'UTR中各含一内含子序列,全长分别为1103 bp、1111 bp;GhFAD2-1成熟mRNA的5'UTR为77bp,转录的起点碱基为T;5'UTR内含子两个剪切位点分别AA-GG、CA-GC.该内含子包括一些典型的与光响应相关的作用元件,以及与激素和胁迫因素相关的应答元件等.[结论]克隆获得了棉花A、D基因组的GhFAD2-1基因5'UTR内含子序列;明确其转录的起点碱基及5'UTR内含子的剪切位点,为进一步在分子水平上研究 GhFAD2-1功能及其表达调控规律,为植物的遗传改良奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙杰	石河子大学农学院	71	385	10.0	16.0
2	张新宇	石河子大学农学院	14	51	4.0	6.0
3	刘峰	石河子大学农学院	14	41	3.0	6.0
4	文凤	石河子大学农学院	3	5	1.0	2.0
5	孙亮	石河子大学农学院	2	0	0.0	0.0