秦川牛和郏县红牛GBP2基因拷贝数变异检测及其对生长性状的效应分析

• 作者: 宋成创 张桂民 文逸凡 曹修凯 贺花 逯倩倩 郑立 陈宏 雷初朝 黄永震
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: GBP2基因 qPCR 拷贝数变异 生长性状 关联分析
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 51-54,64
• 页数: 5页
• 分类号: S823.2
• 字数: 2932字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.2018-01-051

摘要

本研究旨在黄牛中检测GBP2基因的拷贝数变异及其遗传效应分析.运用实时定量荧光PCR (qPCR)技术,分别在80头秦川牛和30头郏县红牛个体中检测GBP2基因2个拷贝数变异CNV1和CNV2,并对GBP2基因这2个拷贝数变异与黄牛的生长性状进行关联分析.结果表明:GBP2基因拷贝数在秦川牛和郏县红牛中均存在Gain(拷贝数增加)、Median(拷贝数正常)和Loss(拷贝数缺失)3种类型;关联分析发现,GBP2基因拷贝数变异对秦川牛体长、体高和体重等几个重要性状的影响差异显著(P＜0.05),其中CNV1和CNV2均表现为Loss/Median型在生长性状上优于Gain型;在郏县红牛中CNV1为Loss型的个体在腰角竞和坐骨端宽性状上显著强于Gain/Median型,CNV2则在体高上表现为Loss型优于Median型(P＜0.05).因此,GBP2基因的拷贝数变异CNV1和CNV2均与生长性状显著相关,可作为秦川牛和郏县红牛的生长性状辅助选择分子标记之一.