壳斗科植物叶绿体基因组结构及变异分析

• 作者: 冯若宣 宋菊 张妍彤 林丽梅 邢朝斌 黄剑
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 壳斗科 叶绿体基因组 结构 变异 系统发育
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 757-765
• 页数: 9页
• 分类号: S664.4
• 字数: 6007字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2018.05.016

摘要

利用生物信息学方法比较壳斗科6个属14个物种的叶绿体基因组间差异,以近缘物种榛为外类群构建系统进化树,揭示壳斗科叶绿体基因组的结构特征及变异规律.结果显示,14种壳斗科植物的叶绿体基因组均为双链环状分子结构,大小在160 kB左右,差异较小,最大仅差1 366 bp;基因顺序基本一致,而基因数量有所差异,infA 、petG、rpl22、ycf1、ycfl5等多个基因在部分物种中发生丢失;主要有32个蛋白编码基因长度发生变异,其原因是内含子的丢失、内含子或者编码区的长度改变,华南锥基因长度变异较大;4个IR边界相对保守,但锥栗、Castanea pumila、华南锥3个物种由于边界扩张导致rps19基因部分序列进入到IR区;以榛为外类群构建的系统发育树,各进化支支持率较高,分辨率较好.研究结果表明,叶绿体基因组可以用于分析关系较近与进化较快物种的系统发生问题,为系统发育和进化研究提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄剑	百色学院农业与食品工程学院	8	12	2.0	3.0
2	张妍彤	华北理工大学生命科学学院	5	4	1.0	2.0
3	宋菊	华北理工大学生命科学学院	8	24	3.0	4.0
4	林丽梅	华北理工大学生命科学学院	6	11	2.0	3.0
5	冯若宣	华北理工大学生命科学学院	4	5	1.0	2.0
6	邢朝斌	华北理工大学生命科学学院	28	59	5.0	6.0