汉防己甲素作用胃癌细胞系HGC-27后差异表达miRNAs筛选及生物信息学分析

• 作者: 张娜 张巨峰 杨艳红 陈娟 陈雪艳 黎昆东
• 来源期刊: 广东药科大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 胃癌 汉防己甲素 微小RNA 高通量测序 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 药理学
• 页码范围: 468-473
• 页数: 6页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 3574字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16809/j.cnki.2096-3653.2018042002

摘要

目的 筛选汉防己甲素(Tet)处理胃癌细胞系HGC-27后差异表达的微小RNA(miRNAs),并进行生物信息学分析.方法 应用高通量测序技术对HGC-27细胞和Tet处理后的HGC-27细胞进行miRNAs差异表达谱分析;结合文献报道确定4个与肿瘤相关的miRNAs,对其进行靶基因预测及信号转导通路的分析.结果 经Tet处理后,miR-7641和miR-149-3p的表达水平明显上调,miR-500a-5p和miR-122-5p的表达水平明显下调;生物信息学方法分析结果显示miR-7641、miR-149-3p、miR-500a-5p、miR-122-5p及其靶基因参与细胞迁移、细胞周期和凋亡等通路.结论 Tet可能通过调控miR-7641、miR-149-3p、miR-500a-5p、miR-122-5p的表达参与胃癌的发生发展.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张娜	广东药科大学生命科学与生物制药学院	9	7	2.0	2.0
2	黎昆东	广东药科大学生命科学与生物制药学院	7	11	2.0	3.0
3	陈娟	广东药科大学生命科学与生物制药学院	8	7	2.0	2.0
4	张巨峰	广东药科大学生命科学与生物制药学院	9	11	2.0	3.0
5	陈雪艳	广东药科大学生命科学与生物制药学院	4	2	1.0	1.0