群体细胞Hi-C文库的建立及其质量控制

• 作者: 戴勇 杨孟 杨明 林华 欧明林 肖敏 荆环云 龚蔚蔚
• 来源期刊: 医学分子生物学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: Hi-C技术 文库建立 质量控制
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 140-144
• 页数: 5页
• 分类号: R34
• 字数: 3898字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3870/j.issn.1672-8009.2018.03.004

摘要

目的 验证常规Hi-C(highest-throughput chromosome conformation capture)建立文库的方法,并留意其中的关键步骤和注意事项,为以后的研究者提供参考依据.方法 收集染色体核型异常者和正常者各2例的外周血标本,提取单个核细胞,经甲醛交联后,按照常规Hi-C方法,构建Hi-C文库,并对实验过程进行浓度检测、 交联效果检测、 染色质完整性检测、 文库质量检测等质量控制.结果 构建了4个Hi-C文库,对常规Hi-C流程的各个质量质控点的检测结果均符合Hi-C建库的要求.结论 常规Hi-C流程的可重复性是可靠的.