静宁鸡肌肉生长抑制素基因单核苷酸多态性筛查及生物信息学分析

• 作者: 刘丽霞 岳炳辉 张丽 戴洪伟 王瑞 陈红
• 来源期刊: 浙江大学学报（农业与生命科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 静宁鸡 肌肉生长抑制素基因 单核苷酸多态性 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 动物科学与动物医学
• 页码范围: 629-637
• 页数: 9页
• 分类号: S831.2
• 字数: 7146字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3785/j.issn.1008-9209.2016.10.242

摘要

为了在静宁鸡群体中筛选出肌肉生长抑制素基因(myostatin,MSTN)突变个体,通过若干世代选育而培育出产肉率较高的优良家禽品种,以第5世代静宁鸡为试验对象构建DNA混合池,通过分段扩增获得静宁鸡MSTN基因编码序列,并对其进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)筛查和生物信息学分析.结果表明:静宁鸡MSTN基因编码区全长1128 bp,编码375个氨基酸,该蛋白为亲水性蛋白;编码区共筛查到4个SNPs,分别为exonl-c.60G＞A、exonl-c.195C＞G、exonl-c.234G＞A、exon3-c.966G＞T,均为同义突变;核苷酸突变后mRNA二级结构和自由能的改变导致其结构稳定性发生改变;蛋白质二、三级结构的主要元件为无规则卷曲,延伸链、a-螺旋和β-转角则散布于整个蛋白质结构中.综上表明,静宁鸡MSTN基因具有较高的突变性,为静宁鸡生长性状的标记辅助选择提供了分子基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘丽霞	西北民族大学生命科学与工程学院	60	132	6.0	9.0
2	张丽	西北民族大学生命科学与工程学院	53	105	5.0	6.0
3	戴洪伟	西北民族大学生命科学与工程学院	13	23	3.0	4.0
4	陈红	西北民族大学生命科学与工程学院	15	50	4.0	6.0
5	王瑞	西北民族大学生命科学与工程学院	5	13	3.0	3.0