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摘要:
Sleepiness affects normal social life,which attracts more and more attention.Circadian phenotypes contribute to obvious individual differences in susceptibility to sleepiness.We aimed to identify candidate single nucleotide polymorphisms (SNPs) which may cause circadian phenotypes,elucidate the potential mechanisms,and generate corresponding SNP-gene-pathways.A genome-wide association studies (GWAS) dataset of circadian phenotypes was utilized in the study.Then,the Identify Candidate Causal SNPs and Pathways analysis was employed to the GWAS dataset after quality control filters.Furthermore,genotype-phenotype association analysis was performed with HapMap database.Four SNPs in three different genes were determined to correlate with usual weekday bedtime,totally providing seven hypothetical mechanisms.Eleven SNPs in six genes were identified to correlate with usual weekday sleep duration,which provided six hypothetical pathways.Our results demonstrated that fifteen candidate SNPs in eight genes played vital roles in six hypothetical pathways implicated in usual weekday bedtime and six potential pathways involved in usual weekday sleep duration.
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篇名 Pathway-based analysis of genome-wide association study of circadian phenotypes
来源期刊 生物医学研究杂志(英文版) 学科 医学
关键词
年,卷(期) 2018,(5) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 361-370
页数 10页 分类号 R737.9
字数 语种 英文
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生物医学研究杂志(英文版)
双月刊
1674-8301
32-1810/R
16开
南京市汉中路140号
1987
eng
出版文献量(篇)
1328
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