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实验室饲养和野外生存条件下东方田鼠肠道菌群的多样性
实验室饲养和野外生存条件下东方田鼠肠道菌群的多样性
作者:
冯洁
林金杏
柏熊
沈志敏
王胜昌
谢建云
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
东方田鼠
肠道菌群
16SrDNA
多样性
摘要:
目的 探讨实验室饲养和野外生存条件下东方田鼠肠道菌群的分布和差异.方法 应用高通量测序技术测定实验室饲养和野外捕捉东方田鼠的肠道细菌16S rDNA-V4-V5区序列,统计操作分类单元(OTUs)数量,分析菌群物种丰度、分布及差异性.结果 稀疏曲线表明取样数量合理,测序充分.在门水平,实验室饲养和野外生存的肠道菌群分布和占比基本相似,实验组有1个独有的门,即黏胶球形菌门(Lentisphaerae),野生组有3个独有的门,分别是梭杆菌门(Fusobacteria)、奇古菌门(Thaumarchaeota)和未分类的门,丰度差异最大的为软壁菌门(Tenericutes).在属水平,野外东方田鼠肠道细菌较实验室饲养的丰富,丰度差异最大的为瘤胃球菌属(Ruminococcus).结论 获得了实验室饲养和野外生存条件下东方田鼠肠道菌群结构和差异性,进一步充实了东方田鼠基础生物学数据.
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文献信息
篇名
实验室饲养和野外生存条件下东方田鼠肠道菌群的多样性
来源期刊
中国实验动物学报
学科
生物学
关键词
东方田鼠
肠道菌群
16SrDNA
多样性
年,卷(期)
2018,(2)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
188-194
页数
7页
分类号
Q95-33
字数
4201字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1005-4847.2018.02.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
林金杏
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谢建云
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冯洁
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王胜昌
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二级引证文献(0)
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肠道菌群
16SrDNA
多样性
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研究来源
研究分支
研究去脉
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中国实验动物学报
主办单位:
中国实验动物学会
中国医学科学院医学实验动物研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1005-4847
CN:
11-2986/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区潘家园南里5号
邮发代号:
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
2300
总下载数(次)
5
总被引数(次)
16300
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