鸡基质蛋白3核定位信号的预测与鉴定

• 作者: 倪萌萌 嵇辛勤 段志强 袁超 赵佳福 邓珊珊 高洪波
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 基质蛋白3 核定位信号 细胞核定位
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 基础兽医
• 页码范围: 2486-2495
• 页数: 10页
• 分类号: S831|Q71
• 字数: 5523字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2018.11.021

摘要

本研究旨在预测和鉴定鸡基质蛋白3(matrin 3,MATR3)的核定位信号(nuclear localization signal,NLS).通过核定位信号在线预测软件预测鸡MATR3蛋白中存在的假定NLS(putative NLS,pNLS),根据预测结果构建鸡MATR3蛋白pNLS缺失的重组真核表达载体,转染细胞后通过观察缺失体重组蛋白的亚细胞定位来确定其NLS.根据鸡MATR3蛋白NLS邻近碱性氨基酸序列特征,构建NLS邻近氨基酸缺失的重组真核表达载体,转染细胞后通过荧光观察和亚细胞定位分析来确定NLS邻近碱性氨基酸是否参与鸡MATR3蛋白的细胞核定位.另外,对鸡MATR3蛋白NLS在不同物种间的保守性以及对外源蛋白的核输入能力进行分析和检测.结果表明,鸡MATR3蛋白中存在4个pNLS,其中pNLS2 (596 PSDKKSK602)缺失导致鸡MATR3蛋白丧失细胞核定位特征.将构建的鸡MATR3蛋白NLS邻近碱性氨基酸缺失的重组真核表达载体转染细胞,通过荧光观察和亚细胞定位分析,发现鸡MATR3蛋白NLS邻近的碱性氨基酸不参与NLS介导的MATR3蛋白细胞核定位.此外,笔者发现该NLS基序在不同物种的MATR3蛋白中均保守,并且与SV40大T抗原NLS具有相同的核输入能力.鸡MATR3蛋白中存在一个高度保守的NLS(596 PSDKKSK602),其邻近的碱性氨基酸位点不参与MATR3蛋白的细胞核定位.