高通量基因芯片在压载水中检测致病菌的应用

• 作者: 卢钟山 张子龙 张继伦 李平 李晓虹 李深伟 田桢干 邱瑾
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 高通量芯片 食源性致病菌 快速检测 压载水
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 压载水取样与检测技术
• 页码范围: 431-437
• 页数: 7页
• 分类号: R185.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.12024/jsou.20180310010

摘要

在口岸压载水检测中发现有多种食源性致病菌的存在,给公共卫生和口岸生态环境带来极大风险.目前对食源性致病菌的检测主要是通过细菌的培养及生化鉴定、荧光PCR等方法,但是不能同时检测多种致病菌.本研究针对一种能检测12种食源致病菌的芯片进行了应用研究,用参比菌株和实验室自分离的菌株检测该芯片的特异性,结果表明该芯片的特异性良好,在所检测的菌株之间无交叉反应.在DNA水平上可以检测到110 ～7 000 copy的DNA分子,在菌裂解液的水平上可以检测到104 ～ 105 copy数目的菌体,样品添加实验证明1 cfu/mL的菌浓度就可以通过增菌后芯片检测到.该芯片可鉴别金黄色葡萄球菌、阪崎肠杆菌、肠出血性大肠杆菌0157:H7、霍乱弧菌、志贺氏痢疾杆菌、空肠弯曲杆菌、单增李斯特菌、副溶血性弧菌、弯曲肠杆菌、沙门氏菌、志贺氏菌、蜡样芽孢杆菌和产气荚膜杆菌等.研究证明该芯片的灵敏度比PCR水平略低,但是其具备高通量、快速、准确,简单易操作等优点,可以应用于口岸压载水中携带食源致病菌的快速检测.