海水和淡水养殖凡纳滨对虾肠道和鳃的菌群结构分析

• 作者: 周俊芳 房文红 李新苍 王元 赵姝 韦信贤 马荣荣
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 凡纳滨对虾 肠道 鳃 海水养殖 淡水养殖 菌群结构 高通量测序
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产
• 页码范围: 198-203
• 页数: 6页
• 分类号: S917.1
• 字数: 4650字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2018.02.016

摘要

运用Miseq高通量测序技术,分析凡纳滨对虾虾苗及其在海水和淡水2种养殖条件下生长到体长9~10 cm时的肠道和鳃的菌群结构.结果显示:虾苗、肠道和鳃样品在门水平上菌群均以厚壁菌门和变形菌门为主,但丰度差异较大;在属水平上,虾苗菌群以乳球菌属(36.1%)、未成功分属的γ–变形菌纲的菌株(25.5%)、芽孢杆菌属(13.5%)、Solibacillus(7.9%)、假单胞菌属(5.0%)和节杆菌属(2.5%)为主,鳃的菌群以乳球菌属、芽孢杆菌属、Solibacillus、假单胞菌属和节杆菌属为主,肠道菌群在海水养殖中的以发光杆菌属(22.9%)、弧菌属(18.2%)、乳球菌属(13.3%)、纤维弧菌属(8.0%)、希瓦氏菌属(5.5%)和芽孢杆菌属(5.4%)为主,而在淡水养殖中的以希瓦氏菌属(57.4%)、乳球菌属(18.8%)和芽孢杆菌属(6.3%)为主,弧菌丰度小于0.1%.养殖条件对凡纳滨对虾鳃中菌群结构影响较小,但对肠道菌群结构影响较大.