淡水养殖凡纳滨对虾生长相关基因HDAC1克隆及其表达分析

• 作者: 骆永丽 刘红 于忠利 王文雁 戴习林
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 凡纳滨对虾 HDAC1基因 肠道 生长调节 淡水养殖
• 年，卷（期）: 2022,（5）
• 所属期刊栏目: 水产科学
• 页码范围: 1388-1398
• 页数: 10页
• 分类号: S966.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2022.05.021

摘要

【目的】分析组蛋白去乙酰基酶1基因（HDAC1）在不同淡水生长特性家系凡纳滨对虾中的表达情况，明确HDAC1基因在对虾淡水养殖过程中的功能作用，为揭示凡纳滨对虾生长调控的分子机制提供参考依据。【方法】通过RACE克隆凡纳滨对虾HADC1基因cDNA序列，利用DNAMAN、ProtParam、ProtScale、PSORT等在线软件进行生物信息学分析，以实时荧光定量PCR检测凡纳滨对虾HDAC1基因组织表达特征；选取4个家系凡纳滨对虾在1‰盐度下进行淡水养殖，养殖70 d后统计对虾存活率（RS）、日增重率、体长日增率、特定生长率（SGR）及饲料转化率（FCR），并利用实时荧光定量PCR检测凡纳滨对虾肠道中的HDAC1基因表达情况。【结果】凡纳滨对虾HDAC1基因cDNA全长3230 bp，包括67 bp的5'非编码区（5'-UTR）、1711 bp的3'非编码区（3'-UTR）及1452 bp的开放阅读框（ORF），共编码483个氨基酸残基；HDAC1基因DNA全长4692 bp，含有8个外显子和7个内含子。凡纳滨对虾HDAC1基因编码蛋白分子量为54640.22 Da，理论等电点（pI）为5.59，属于稳定的亲水性蛋白，具有1个Histone deacetylase 1结构域，无跨膜结构。凡纳滨对虾HDAC1氨基酸序列与斑节对虾HDAC1氨基酸序列的相似性最高，达99.79%。HDAC1基因在凡纳滨对虾各组织中均有表达，以在肠道中的相对表达量显著高于在其他组织中的相对表达量（P<0.05）；在4个家系群体中，无论是大虾还是小虾，生长慢的群体中HDAC1基因相对表达量较低，生长快的群体中HDAC1基因相对表达量较高。【结论】HDAC1基因在凡纳滨对虾各组织中均有表达，以肠道中的相对表达量最高，且HDAC1基因相对表达量与凡纳滨对虾的生长速度成正比，故推测其参与凡纳滨对虾的生长调节过程。