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凡纳滨对虾HSP10基因序列与低温表达分析
凡纳滨对虾HSP10基因序列与低温表达分析
作者:
彭金霞
殷勤
蒋小珍
陈晓汉
韦嫔媛
黎铭
原文服务方:
南方农业学报
凡纳滨对虾
热休克蛋白
HSP10基因
低温
表达量
荧光定量PCR
摘要:
[目的]克隆分析凡纳滨对虾HSP10基因,为研究其在寒冷耐受过程中发挥调控功能提供参考依据.[方法]搜索EST库获得凡纳滨对虾HSP10基因序列,再通过RACE-PCR扩增获得凡纳滨对虾HSP10基因cDNA全长序列,对其进行生物信息学分析,并通过荧光定量PCR分析HSP10基因的组织表达及低温胁迫下表达量的变化.[结果]凡纳滨对虾HSP1基因cDNA全长720 bp,包含306 bp的开放阅读框,编码102个氨基酸.以各物种的HSP10蛋白序列构建系统进化树,能较好反映各物种间的进化关系.荧光定量PCR分析结果显示,凡纳滨对虾HSP10mRNA在各组织中呈遍在表达,其中以肌肉中的表达量最高.低温表达谱分析结果显示,凡纳滨对虾HSP10mRNA在低温处理凡纳滨对虾的各组织中均呈下调表达,当处理温度降至13℃,其在肝胰腺中表达量降至最低.[结论]凡纳滨对虾HSP10在结构和进化上较保守,其mRNA表达量在低温胁迫下呈下降趋势,可能在寒冷耐受过程中发挥负调控作用.
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期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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文献信息
篇名
凡纳滨对虾HSP10基因序列与低温表达分析
来源期刊
南方农业学报
学科
关键词
凡纳滨对虾
热休克蛋白
HSP10基因
低温
表达量
荧光定量PCR
年,卷(期)
2013,(5)
所属期刊栏目
畜牧·兽医·水产·蚕桑
研究方向
页码范围
838-843
页数
6页
分类号
S945.46
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j:issn.2095-1191.2013.5.838
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
陈晓汉
广西水产研究所/广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室
62
510
10.0
20.0
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
版权信息
全文
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热休克蛋白
HSP10基因
低温
表达量
荧光定量PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南方农业学报
主办单位:
广西壮族自治区农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1191
CN:
45-1381/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1964-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7029
总下载数(次)
0
总被引数(次)
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