基于YAP流水线的影像组学研究流程的实现

• 作者: 宋阳 李冬宝 杨光 罗庆 谢海滨
• 来源期刊: 磁共振成像
• 学科: 医学
• 关键词: 图像处理,计算机辅助 磁共振成像 编程语言 医学
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 技术研究
• 页码范围: 533-538
• 页数: 6页
• 分类号: R445.2|R739.41
• 字数: 3413字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12015/issn.1674-8034.2018.07.009

摘要

目的 在又一条流水线(yet another pipeline,YAP)磁共振软件流水线框架基础上,增加对影像组学研究的支持.材料与方法 在YAP中实现了对Python语言的支持,使得YAP流水线中可以嵌入Python语言编写的处理器;在此基础上,利用PyRadiomics软件包在YAP中实现了影像组学处理流水线.利用流水线,对BRATS2017公开数据集的高级别胶质瘤和低级别胶质瘤分级问题进行了研究.结果 利用C++和Python混合编程,构建了完整的影像组学流水线,BRATS2017数据集的肿瘤分级在选择12个特征时,获得的最佳准确率达到了94.5％,受试者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线的曲线下面积(area under curve,AUC)达到了0.9650.结论 利用Python和C++的混合编程以及YAP框架提供的基础设施,可以方便地进行影像组学研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢海滨	华东师范大学物理与材料科学学院上海市磁共振重点实验室	12	24	3.0	4.0
3	罗庆	华东师范大学物理与材料科学学院上海市磁共振重点实验室	3	7	2.0	2.0
4	宋阳	华东师范大学物理与材料科学学院上海市磁共振重点实验室	4	6	1.0	2.0
5	李冬宝	华东师范大学物理与材料科学学院上海市磁共振重点实验室	2	6	1.0	2.0