用45个SNP位点组合对国家啮齿类实验动物种子中心3个封闭群小鼠群体的遗传状况分析

• 作者: 张钰 李银银 李长龙 杜小燕 王洪 郭萌 陈振文 魏杰 黄韧
• 来源期刊: 实验动物科学
• 学科: 生物学
• 关键词: ICR小鼠 KM小鼠 单核苷酸多态性 群体遗传
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: Q789
• 字数: 4335字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-6179.2018.01.001

摘要

目的 利用单核苷酸多态性位点对国家啮齿类实验动物种子中心3个封闭群小鼠群体进行群体遗传结构分析.方法 选取文献中45个SNP位点,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术对来自国家啮齿类实验动物种子中心北京和上海分中心的ICR各1个群体,上海分中心的1个KM封闭群小鼠样本进行等位基因分型,分析群体遗传结构,并进行群体间遗传差异分析.结果 3个封闭群小鼠有效等位基因数(Ne)、观察杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、平均杂合度(Ha)、多态信息含量(PIC)、香隆信息指数等遗传参数各不相同.同一群体的结果与微卫星DNA和生化位点的结果相比,SNP检测的参数值较低.但将3个群体中单态的SNP位点去除后参数值有所上升,尤其香隆指数值与STR检测结果接近.结论 所选SNP位点可用于封闭群小鼠遗传质量检测,所检测的3个群体遗传多样性用杂合度评价为SKM＞BICR ＞SICR.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄韧		168	1009	16.0	22.0
2	张钰		42	240	7.0	13.0
3	陈振文	首都医科大学基础医学院	78	366	11.0	15.0
4	魏杰		32	104	6.0	9.0
5	王洪		45	154	7.0	10.0
6	李长龙	首都医科大学基础医学院	19	30	3.0	4.0
7	李银银	首都医科大学基础医学院	4	2	1.0	1.0
8	郭萌	首都医科大学基础医学院	14	57	5.0	7.0