大肠杆菌MurD抑制剂的分子对接与3D-QSAR研究

• 作者: 戴康 李天恩 覃初新 马建
• 来源期刊: 湖北大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 大肠杆菌MurD抑制剂 分子对接 CoMFA 3D-QSAR模型
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 微生物与酶资源研究专栏
• 页码范围: 462-469
• 页数: 8页
• 分类号: R914.2
• 字数: 2780字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2375.2018.05.005

摘要

UDP-N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸-D-谷氨酸连接酶(MurD)在细胞质中催化D-谷氨酸(D-Glu)和UDP-N-乙酰胞壁酰-￡-丙氨酸(UDP-MurNAc-L-Ala)之间的酰胺键形成UDP-N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸-D-谷氨酸(UDP-MurNAc-L-Ala-D-Glu).由于MurD对D型氨基酸表现出非常高的特异性,使得它被认为是发现选择性抗菌剂的新靶标之一.通过利用从相关文献中获取的31个大肠杆菌MurD抑制剂建立3D-QSAR预测模型.以分子对接获得的打分较高的活性构象为模版,对选择的分子进行叠合,从中随机选择26个化合物作为训练集建立比较分子场分析(CoM FA)模型,该模型的去一交叉验证(LOO)相关系数q2=0.515 (CoMFA).剩余的5个化合物组成测试集以验证模型的预测性能,相应的相关系数R2press =0.701 8(CoMFA).结果表明建立的CoMFA模型具有较好的预测能力,研究结果将为今后的MurD抑制剂设计和开发提供参考信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	戴康	中南民族大学药学院	22	39	3.0	4.0
2	李天恩	中南民族大学药学院	4	1	1.0	1.0
3	覃初新	中南民族大学药学院	3	1	1.0	1.0
4	马建	中南民族大学药学院	5	0	0.0	0.0