樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒(GHPV)全基因组克隆与分析

• 作者: 万春和 傅光华 傅秋玲 刘荣昌 施少华 程龙飞 陈红梅 陈翠腾 黄瑜
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鹅出血性多瘤病毒(GHPV) 樱桃谷鸭源 基因组 序列分析 遗传进化
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1410-1418
• 页数: 9页
• 分类号: S855.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2018.08.014

摘要

鹅出血性多瘤病毒(Goose hemorrhagic polyomavirus,GHPV)为近年来我国鸭群新发病原.为明确我国鸭源GHPV基因组特征,本研究利用分段PCR扩增技术克隆获得樱桃谷鸭(Anas platyrhynchosdomestica)源GHPV(FJ201601株)全基因组序列,并对其进行核苷酸同源性比较和遗传进化分析.结果表明,克隆的GHPV(FJ201601株)全基因组序列长为5 254 bp(GenBank登录号MG544856),(G+C)％含量为48.01％,编码的6个主要功能基因(ORF-X,VP2,VP3,VP1,Large T和Small T)长度分别为510、981、654、1062、1 911和483 bp.核苷酸同源性分析表明,FJ201601株和其他不同地区、不同宿主来源GHPV相互之间基因组核苷酸同源性较高(99.7％以上);其6个主要功能基因和其他不同地区、不同宿主来源GHPV相应基因的核苷酸(99.4％以上)和氨基酸同源性(98.2％以上)均极高.从全基因组及其编码的6个主要功能基因遗传进化关系可见,GHPV各分离株在基因组上亲缘关系较近,6个主要功能基因在遗传进化上差异不大,但北京鸭源GHPV和樱桃谷鸭源GHPV在遗传进化上仍存在细微差别,且不同宿主(多品种鸭和鹅)源GHPV在遗传进化上不存在宿主特异性.本研究丰富了GHPV分子流行病学数据,明确了GHPV基因组分子特征,为后续开展GHPV相关研究提供参考.