猪胚胎期小肠组织MKRN3基因启动子区CpG岛的甲基化模式分析

• 作者: 付书林 刘玉兰 张晶 张阳 汪龙梅 郭玲 陈洪波
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: DNA甲基化 重亚硫酸盐测序法 MKRN3基因 CpG岛
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 38-42
• 页数: 5页
• 分类号: S828.2
• 字数: 4620字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.2018-06-038

摘要

为揭示猪MKRN3基因启动子区CpG岛在胚胎小肠组织的甲基化模式,本实验以梅山猪-大白猪正反交为模型,以65、100日龄的胚胎小肠组织为研究材料,首先利用生物信息学手段预测猪MKRN3基因的启动子区CpG岛,围绕预测的CpG岛设计引物,采用重亚硫酸盐测序法检测梅山猪、大白猪正反交不同发育时期胚胎小肠组织中目的基因的甲基化水平.结果表明:在大白×梅山65日龄胚胎小肠中,猪MKRN3基因启动子区CpG岛呈现高度甲基化(70.8％),而在梅山×大白65日龄胚胎小肠中呈现低甲基化(8.4％),正反交后代的甲基化模式截然相反;在大白×梅山100日龄胚胎小肠组织中,目的基因CpG岛呈现低甲基化(16.4％),而在梅山×大白100日龄胚胎小肠组织中的平均甲基化水平为37.2％.MKRN3基因启动子区CpG岛的甲基化模式随着正反交、胚胎发育时期不同而呈现出一定变化规律,推测该基因的DNA甲基化具有父母本等位基因偏好性,且在胚胎发育65～100日龄父本或母本等位基因可能会发生明显的去甲基化.本研究结果为进一步阐明猪MKRN3甲基化水平调控其基因表达及印记状态提供一定理论基础.