少量胃癌细胞SHP1基因启动子区CpG岛甲基化的状态

• 作者: 康亚妮 张晓丽 赖登攀 赵小东 陈健
• 来源期刊: 肿瘤防治研究
• 学科: 医学
• 关键词: 胃癌 甲基化 SHP1基因 甲基化特异性PCR
• 年，卷（期）: 2014,（8）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 871-875
• 分类号: R735.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.2014.08.003

摘要

目的 检测胃癌细胞中SHP1基因启动子区CpG岛异常甲基化状态.方法 使用甲基化分析软件Cpgplot预测SHP1基因转录起始位点-1 000 bp～1 340 bp区域的CpG岛并用MethPrimer软件设计甲基化特异性PCR(MSP)引物;建立一种基于Bisulfite修饰、无需提取DNA而直接检测少量细胞甲基化的新方法,并将其用于胃癌细胞SHP1基因启动子区甲基化状态的检测;克隆MSP产物、Sanger测序、分析测序峰图;比较Bisulfite修饰前后序列并分析CpG位点甲基化状态.结果 MSP引物均位于SHP1基因第一外显子区近转录起始位点;CpG岛长度＞200 bp、GC含量＞50％、Obs/Exp＞0.60; MSP检测仅出现甲基化引物特异性扩增条带,提示该区域高甲基化.结论 胃癌细胞中SHP1基因启动子区CpG岛存在高甲基化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖登攀		1	1	1.0	1.0
2	张晓丽		1	1	1.0	1.0
3	陈健		1	1	1.0	1.0