大白菜BrCNGC全基因组鉴定及其表达分析

• 作者: 侯喜林 吕善武 张昌伟 汪影
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大白菜 环核苷酸门控离子通道基因(CNGC) 全基因组分析 芜菁花叶病毒(TuMV) 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 植物科学
• 页码范围: 994-1002
• 页数: 9页
• 分类号: S634.1
• 字数: 4488字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201801037

摘要

[目的]本文旨在研究大白菜环核苷酸门控离子通道基因(BrCNGC)的进化关系、结构特征、染色体定位及其表达模式.[方法]通过生物信息技术对大白菜BrCNGC进行分子进化分析、功能结构分析、染色体定位分析、保守结构域分析,并且通过荧光定量PCR分析该基因家族在脱落酸(ABA)+芜菁花叶病毒(TuMV)、水杨酸(SA) +TuMV、茉莉酸甲酯(MeJA)+TuMV和抗坏血酸(AsA) +TuMV处理下的表达差异.[结果]大白菜BrCNGC家族有26个成员,可分为4个组(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ),其中第Ⅳ组又可以分为2个亚组(Ⅳa和Ⅳb).它们分布在9条染色体上,1号染色体上BrCNGC数量最多(有5个),5号染色体上只有1个BrCNGC基因,而8号染色体上没有BrCNGC基因分布.基因结构分析表明:该家族基因中共鉴定出10种motif,其中有14个BrCNGC蛋白都包含这10种motif,同组成员之间的motif组成相似.荧光定量PCR结果表明:在植物生长调节剂与TuMV相互作用下,大部分BrCNGC的表达量上调,少数BrCNGC的表达量下调.[结论]大白菜BrCNGC结构高度保守,其在大白菜抵御TuMV侵染过程中发挥一定的作用,该发现为以后进一步研究BrCNGC的功能奠定了基础.