大白菜GID1家族基因鉴定及表达模式分析

• 作者: 宋晴晴 张一卉 张慧敏 张烨 李化银 李景娟 王凤德 贺立龙 高建伟
• 来源期刊: 山东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大白菜 GID1基因 生物信息学分析 表达模式分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术·遗传育种·种质资源
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: S634.103|Q78
• 字数: 4648字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2020.03.001

摘要

GID1蛋白是赤霉素信号转导过程中的重要受体,在调控植物生长发育过程中发挥重要作用.本研究采用生物信息学分析方法对大白菜基因组中GID1家族基因进行鉴定,并对该基因结构、染色体分布、系统进化以及表达模式等进行分析.结果表明,大白菜基因组中含有5个GID1家族成员,分别位于4、5、6、7、9号染色体上,各成员都只含有1个内含子.系统进化结果显示,单子叶和双子叶植物的GID1蛋白明显处于两个不同分支,大白菜GID1家族成员与拟南芥GID1具有更近的亲缘关系.通过表达模式以及启动子顺式响应元件分析发现,大白菜GID1基因不仅参与生长发育调控还可能参与对不同环境因子的响应过程.