大白菜BrROP基因家族的生物信息学分析

• 作者: 刘少华 王晗 许晔 闫敏 顾小敏
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大白菜 BrROP基因家族 生物信息学 系统分析
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 93-100
• 页数: 8页
• 分类号: S634.1
• 字数: 4122字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2020.04.013

摘要

为了揭示大白菜BrROP基因家族的功能和进化关系,利用生物信息学方法对大白菜BrROP基因家族成员进行了鉴定,并对其基因结构、蛋白质序列、染色体定位、保守结构域、进化关系和表达模式等进行系统分析.结果表明,在大白菜基因组中共鉴定出22个BrROP基因成员,在大白菜染色体上呈不均匀分布;氨基酸序列分析表明,BrROP蛋白的结构较保守,均含有G结构域(G1—G5)、效应因子结合点、插入序列和C端可变区;根据系统发育进行聚类分析,大白菜BrROP基因可被分为4类,GroupⅠ、GroupⅡ、GroupⅢ和GroupⅣ;利用EMBL-EBI数据库对BrROP基因家族进行分析,22个BrROP基因在大白菜根、茎、叶、花和角果中呈组织差异表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘少华	江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院	7	2	1.0	1.0
2	闫敏	江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院	4	2	1.0	1.0
3	王晗	江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院	7	2	1.0	1.0
4	许晔	江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院	7	1	1.0	1.0
5	顾小敏	江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院	1	0	0.0	0.0