鸭骨骼肌TNNI1基因CpG岛区甲基化与mRNA差异表达

• 作者: 刘一帆 单艳菊 姬改革 屠云洁 巨晓军 束婧婷 章明
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 鸭 TNNI1基因 启动子 mRNA表达 甲基化
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 1312-1318
• 页数: 7页
• 分类号: Q786
• 字数: 4948字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2018.06.016

摘要

本研究旨在通过克隆鸭慢速骨骼肌型肌钙蛋白I 1(Slow skeletal muscle troponin I 1,TNNI1)基因5′侧翼区序列,检测鸭骨骼肌组织TNNI1基因的mRNA表达水平和启动子CpG岛区甲基化状态,初步探索TNNI1基因转录调控机制.采用染色体步移方法克隆测序获得鸭TNNI1基因5′侧翼区序列,进行生物信息学分析,采用荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,RT-PCR)检测鸭胸肌和腿肌TNNI1基因mRNA表达水平,采用亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)检测核心启动子区CpG岛在鸭肌肉组织中的甲基化水平.结果表明,克隆获得鸭TNNI1基因5′侧翼区序列2078 bp,预测存在2个CpG岛,其中CpG岛(-2032～-1833 bp)位于预测的核心启动子区内,并存在多个真核生物结构元件和转录因子结合位点;甲基化检测发现,其总体甲基化水平在胸肌和腿肌组织中分别为52.66％、57.04％,差异不显著(P>0.05);荧光定量检测结果表明,鸭胸肌和腿肌TNNI1基因表达量差异显著(P<0.05);相关性分析结果表明,CpG4位点甲基化程度与胸肌TNNI1基因表达量呈极显著负相关(P<0.01).鸭胸肌和腿肌TNNI1基因的mRNA表达量存在显著差异,其总体甲基化水平无显著差异.在胸肌中,启动子区CpG4位点可能通过甲基化修饰影响TNNI1基因的转录调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	束婧婷		43	139	7.0	9.0
2	姬改革		26	32	4.0	5.0
3	单艳菊		43	147	7.0	9.0
4	章明		21	40	3.0	6.0
5	屠云洁		15	18	2.0	4.0
6	巨晓军		9	2	1.0	1.0
7	刘一帆		8	2	1.0	1.0