基于外周血细胞基因表达谱筛选检测胃癌的差异表达基因

• 作者: 周喆 林莉 王升启 邵勇 郑越 马秋玲
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 医学
• 关键词: 胃肿瘤 血细胞 RNA测序 基因表达谱 差异表达基因 生物学标记
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 744-748
• 页数: 5页
• 分类号: Q786|R735.2
• 字数: 3884字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2018.10.005

摘要

目的 分析胃癌患者外周血细胞基因表达谱特征,筛选检测胃癌的差异表达基因.方法 对21名胃癌患者和21名健康对照者外周血样本进行RNA测序,利用生物信息学方法获取胃癌的基因表达谱特征.从胃癌的差异表达基因中筛选候选基因,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术在25名胃癌患者和48名健康对照者外周血样本中进行验证.使用受试者工作特征曲线(ROC)和Logistic回归分析评估差异表达基因筛查胃癌的潜力.结果 在胃癌患者与健康对照者外周血测序样本中检测到1258个差异表达基因(642个基因上调,616个基因下调).经过滤后选择差异最显著的30个基因在新样本中进行qRT-PCR验证,其中3个基因(C1QB、MMP9和SMIM1)仍然具有差异性.Logistic回归分析显示3个基因联合鉴别胃癌的灵敏性为92％,特异性为72.92％,ROC曲线下面积为0.8708.结论 胃癌患者外周血细胞基因表达谱发生显著改变,并发现3个差异表达基因在新样本中仍然具有差异性.该研究为检测胃癌提供了一种有前途的非侵入性qRT-PCR方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林莉	北京大学国际医院肿瘤内科	21	227	8.0	15.0
2	郑越	解放军总医院第八医学中心	8	43	4.0	6.0
3	王升启	军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所	4	1	1.0	1.0
4	马秋玲	军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所	7	12	2.0	3.0
8	周喆	军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所	2	0	0.0	0.0
9	邵勇	军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所	1	0	0.0	0.0