海带hsp70基因的克隆、分析及转录水平定量研究

• 作者: 刘福利 孙修涛 梁洲瑞 汪文俊 王飞久 袁艳敏
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 海带‘海天1号’ HSP70 RACE 生物信息学分析 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 152-158
• 页数: 7页
• 分类号: Q75|S917
• 字数: 4755字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19663/j.issn2095-9869.20170407001

摘要

本研究以海带(Saccharina japonica)‘海天1号’为材料,通过RACE-PCR方法获得海带hsp70(Sjhsp70)基因全长cDNA序列.序列分析表明,全长cDNA长度为3778 bp,含有1个2892 bp的开放阅读框,5'和3'非编码区的长度分别为101、785 bp.蛋白质氨基酸含量和理化性质分析显示,该蛋白为稳定蛋白.应用BLASTP程序对不同物种HSP70蛋白比较分析表明,海带与长囊水云(Ectocarpus siliculosus)的HSP70蛋白具有较高的同源性,用HSP70蛋白构建的进化树显示,海带与长囊水云聚为一类.二级结构预测该蛋白由963个氨基酸组成,包含35个α螺旋和25个β折叠.以酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)HSPl10蛋白三维结构3C7N为模板,在I-TASSER软件上预测海带HSP70蛋白的三维结构,预测的蛋白结构与3C7N的A链在折叠和二级结构方面非常类似.对Sj hsp70基因在温度胁迫下表达变化分析表明,高温对Sjhsp 70的表达量具有显著影响,hsp70在25℃、24h胁迫条件时,表达量达到最大值.本研究为阐明海带HSP70蛋白特性及其应对环境胁迫的机理提供理论依据.