悬铃木方翅网蝽触角转录组及嗅觉相关基因分析

• 作者: 朱品红 李定旭 杨海博 胡镇杰 董钧锋
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 悬铃木方翅网蝽 触角转录组 高通量测序 基因注释 嗅觉基因
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 2109-2120
• 页数: 12页
• 分类号: S763.35
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2018.12.012

摘要

悬铃木方翅网蝽(Corythucha ciliata)是专一性危害悬铃木(Platanus acerifolia)的重要害虫.本研究的目的是建立悬铃木方翅网蝽成虫触角转录组数据库,获得与嗅觉相关的基因信息.以悬铃木方翅网蝽雌雄成虫触角为材料,利用高通量测序平台Illumina HiSeqTM 4000进行转录组测序,并进行生物信息学分析.得到平均长度为1 036 bp,N50为1809bp,共65 943条单基因簇(Unigenes).通过同源性比对,成功注释16 600条Unigenes,其中,在NCBI蛋白数据库(NCBI Non-redundant Protein Sequences,Nr)注释的Unigenes与内华达古白蚁(Zootermopsis nevadensis)Unigenes的相似基因序列最多,为14.40％.与基因本体数据库(Gene Ontology,GO)比对发现,6 435条Unigenes,根据其功能大致可分为细胞组分、分子功能和生物过程3大类52亚类,与代谢进程、细胞进程、催化活性和结合相关的Unigenes较多.基因表达分析发现,一共得到1 116个差异表达基因,其中有1 096个基因上调,有20个基因下调.京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析表明,6 309条Unigenes归属于255个通路,有346个差异表达基因,参与碳代谢的基因最多(20个).进一步筛选获得194个嗅觉相关基因,包括77个气味受体基因(odorant receptor,OR),64个气味降解酶基因(odorant degrading enzyme,ODE),26个气味结合蛋白基因(odorant binding protein,OBP),11个离子型受体基因(ionotropic receptor,IR),14个化学感受蛋白基因(chemosensory protein,CSP)和2个感觉神经元膜蛋白基因(sensory neuron membrane protein,SNMP),并用FPKM (fragments per kilobase per million reads)值对基因表达量进行评估.本研究初步阐明悬铃木方翅网蝽成虫触角转录组的整体表达模式,为进一步研究悬铃木方翅网蝽嗅觉调控机理提供了资料基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董钧锋	河南科技大学林学院	42	292	8.0	14.0
2	李定旭	河南科技大学林学院	31	403	12.0	19.0
3	朱品红	河南科技大学林学院	6	7	1.0	2.0
4	胡镇杰	河南科技大学林学院	14	16	2.0	3.0
5	杨海博	河南科技大学林学院	7	12	2.0	3.0