不同鸡品种BLEC1基因序列比较分析

• 作者: 常国斌 张扬 张莘 王志秀 王统苗 郑圣晗 陈博雯 陈国宏
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 BLEC1基因 SNPs Indels 进化树
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 页码范围: 61-66
• 页数: 6页
• 分类号: Q78|S831
• 字数: 3472字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.04.009

摘要

BLEC1基因(C-type lectin-like receptor 1)编码C型凝集素样受体区域,与CD69家族的激活抗原相关,密切联系于禽类的先天性免疫功能.为了探究BLEC1基因在鸡中的遗传多样性以及不同鸡品种之间的抗病性差异,用苯酚和氯仿法提取26个不同鸡品种的DNA,对其BLEC1基因序列进行目标捕获测序,然后以NCBI上红色原鸡的BLEC1基因序列作为参考序列,序列号为NC 006103.4,通过MEGA 6软件对26个鸡品种的BLEC1基因序列进行序列比对分析,筛选出不同鸡种BLEC1基因序列上的SNPs位点和Indels位点以及对应氨基酸的变化,并根据基因序列的差异运用邻接法系统聚类分析构建进化树.在26个鸡品种中共检测到14个SNPs位点和12个Indels位点,其中有5个SNPs位点和3个Indels位点在外显子上,外显子上的3个Indels位点在鸡种中广泛存在,且Indel1存在于除黑狼山鸡以外的所有鸡种中,这些SNPs位点和Indels位点导致氨基酸发生极大改变,外显子中氨基酸有3个发生错义突变,其余为同义突变.邻接法系统聚类分析将26个鸡品种分为3大类,其中,安卡鸡、SPF-来航鸡和泰和乌骨鸡聚为一类;萧山鸡单独为一类;其余鸡种聚为一类.综上表明,BLEC1基因在我国地方鸡品种中有着丰富的遗传多样性,且与不同鸡种的先天性免疫功能和抗病性相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常国斌	扬州大学动物科学与技术学院	91	418	11.0	16.0
2	张扬	扬州大学动物科学与技术学院	59	219	7.0	13.0
3	陈博雯	扬州大学动物科学与技术学院	5	5	2.0	2.0
4	郑圣晗	扬州大学动物科学与技术学院	7	8	2.0	2.0
5	王志秀	扬州大学动物科学与技术学院	7	2	1.0	1.0
6	王统苗	扬州大学动物科学与技术学院	4	5	2.0	2.0
7	张莘	扬州大学动物科学与技术学院	2	2	1.0	1.0
8	陈国宏		1	0	0.0	0.0