不同鸡种BF2基因序列比较分析

• 作者: 吴允 孔令琳 常国斌 郑圣晗 郭其新 陈国宏 陈颖
• 来源期刊: 吉林农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 BF2基因 SNPs位点 Indel位点 进化树
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 345-351
• 页数: 7页
• 分类号: S831.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13327/j.jjlau.2017.3466

摘要

利用目标区域捕获测序技术对BF2(Major histocompatibility complex class I antigen BF2)基因进行序列测定,找出不同鸡种BF2基因序列上的差异.以NCBI网站上Gallus _gallus-5.0的BF2基因序列为参照标准.利用MEGA6.06软件对25个鸡种的基因序列进行比对分析,统计SNPs位点和Indel位点,并构建系统进化树进行分析.结果表明:在BF2第2、3外显子上分别存在22和31个有义突变,占BF2基因全部有义突变的78％,表明BF2基因的第2、3外显子起重要作用且拥有丰富的多态性.第5、6、7外显子属于保守区域.25个鸡种大致可被分为3大类:鹿苑鸡、如皋黄鸡、溧阳鸡和太湖鸡等聚为一类;罗斯鸡和隐性白羽肉鸡等聚为一类;雪山鸡和广西黄鸡等聚为一类.表明中国地方鸡品种间的同源性较小,BF2基因在不同鸡种上具有丰富的遗传多样性,在第2外显子上C/T突变和第3外显子上A/C突变可作为BF2基因有关抗病的候选SNPs位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈国宏	扬州大学动物科学与技术学院	393	3876	28.0	46.0
2	常国斌	扬州大学动物科学与技术学院	91	418	11.0	16.0
3	吴允	扬州大学动物科学与技术学院	8	11	3.0	3.0
4	陈颖	扬州大学动物科学与技术学院	25	58	5.0	7.0
5	孔令琳	扬州大学动物科学与技术学院	7	9	2.0	2.0
6	郑圣晗	扬州大学动物科学与技术学院	7	8	2.0	2.0
7	郭其新	扬州大学动物科学与技术学院	5	6	2.0	2.0