诱导耐药沙门菌CRISPR检测及cas基因表达分析

• 作者: 代兴杨 张瑞良 曾明华 李琳 王文静 王磊 赵霞
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 沙门菌 诱导耐药 成簇间隔短回文重复序列 casmRNA表达量
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 370-376
• 页数: 7页
• 分类号: S859.7
• 字数: 6108字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201701021

摘要

[目的]通过对诱导耐药沙门菌成簇间隔的短回文重复序列(CRISPR)比对分析,以及cas(CRISPR associated)mRNA表达水平的变化,探讨CRISPR/Cas与沙门菌耐药性的关系.[方法]对鼠伤寒沙门菌ATCC13311进行耐药诱导分别获得3株体外诱导耐药(环丙沙星、庆大霉素、氨苄西林)菌和1株体内诱导耐药(环丙沙星)菌,设计引物对CRISPR,进行PCR扩增并检测,应用CRISPR Finder分析CRISPR序列,对5株沙门菌的CRISPR序列进行比对;利用RT-qPCR检测耐药前后沙门菌cas1、cas6、casA mRNA表达水平的变化.[结果]成功扩增出2段CRISPR序列(CRISPR1、CRISPR2),耐药菌碱基的突变均发生在前导区和序列末端;CRISPR1序列的突变发生在前导区的1~4 bp和序列末端的1136~1144 bp 区域内;CRISPR2序列的突变发生在前导区的1~14 bp和序列末端的780~796 bp区域内;重复间隔序列保守且发现有重复序列的退化现象(degeneration repeats,DRs),同时耐药菌cas1、cas6、casA mRNA的表达水平下降.[结论]提示:沙门菌CRISPR序列突变和cas mRNA表达水平下降与其耐药性有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王磊	安徽农业大学动物科技学院	55	207	8.0	11.0
2	曾明华	安徽农业大学动物科技学院	50	364	11.0	16.0
3	李琳	安徽农业大学动物科技学院	37	343	9.0	18.0
4	赵霞	安徽农业大学动物科技学院	16	104	4.0	10.0
5	王文静	安徽农业大学动物科技学院	12	19	2.0	4.0
6	张瑞良	安徽农业大学动物科技学院	11	17	2.0	4.0
7	代兴杨	安徽农业大学动物科技学院	5	19	2.0	4.0