基于高通量测序的花马盐湖原核微生物及其耐盐基因

• 作者: 丁小维 兰阿峰 刘开辉 张波 彭浩 杨学英 牛明月 米洋 邓百万
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 盐湖 宏基因组文库 原核微生物 耐盐基因 高通量测序
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1743-1753
• 页数: 11页
• 字数: 4468字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20170564

摘要

[目的]揭示陕北花马盐湖沉积物原核微生物群落组成,并分析其潜在的耐盐功能基因.[方法]构建盐湖沉积物宏基因组16S rRNA文库和fosmid文库,利用Illumina HiSeq高通量测序及生物信息技术分析细菌古菌群落组成和耐盐菌株(5-5)外源宏基因组的潜在耐盐基因.[结果]获得1 8978条有效的16S rRNA序列,共5221个OTUs,包括23个门,155个属,其中广古菌门(Euryarchaeota)和变形菌门(Proteobacteria)为优势菌门,盐杆状菌属(Halorhabdus)、盐红菌属(Halorubrum)及假单胞菌属(Pseudomonas)等16个属为优势属,以及嗜盐单胞菌属(Halomonas)、冷弯菌属(Psychroflexus)及不动细菌属(Acinetobacter)等139个属为非优势属.从4126个fosmid文库菌株中筛选出37株耐盐菌株,其中菌株5-5、2E4和2F4对不同浓度的NaC1、CuSO4、ZnSO4及CdSO4具有耐受性,从5-5的外源宏基因组序列中获得61个Unigene,其中12个Unigene的同源基因编码的蛋白质如无机焦磷酸酶、转座酶、亚碲酸钾抗性蛋白及钙调蛋白等广泛参与其他生物的耐盐逆境.[结论]盐湖沉积物中蕴藏着丰富多样的细菌古菌类群以及潜在耐盐功能基因资源.