一种新的基于多重液相色谱-质谱实验肽信号峰形相似性的校准算法

• 作者: 商凯 崔健 崔浩 祁鑫 董晓睿 陈强
• 来源期刊: 分析测试学报
• 学科: 化学
• 关键词: 液相色谱-质谱实验 校准 峰形相似性 统计学习算法
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1457-1462
• 页数: 6页
• 分类号: O657.63
• 字数: 4300字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-4957.2018.12.009

摘要

提出了一种基于多次重复液相色谱-质谱(LC-MS)实验,结合肽信号时间差校准的峰形相似性统计学习模型,解决了重复实验数据肽链校准匹配准确性与覆盖率低的问题.采用统计学习的方法,首先建立时间差统计模型,结果表明仅靠时问特征无法完全消除校准误差.因此,除了时间特征,引入了峰形相似性特征,即认为同一种肽链在多次重复实验谱图中会产生相似的LC峰形.通过选取训练数据集,提出了一种新的基于LC峰形相似性的肽信号校准算法,并通过测试序列完成模型测试.结果表明,改进算法的准确率达98.3％;将该数学模型应用于校准匹配两个实验数据的所有LC-MS/MS肽链,其覆盖率达91.0％.峰形相似性特征结合时间特征可以提升多次重复LC-MS实验中相关肽链信号的匹配校准的准确性与覆盖率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	祁鑫	中国石油大学计算机与通信工程学院	14	40	4.0	6.0
2	陈强	中国石油大学胜利学院信息技术系	76	251	9.0	12.0
3	崔健	中国石油大学胜利学院信息技术系	22	66	3.0	7.0
4	崔浩	中国石油大学计算机与通信工程学院	12	20	2.0	4.0
5	董晓睿	中国石油大学胜利学院信息技术系	10	7	1.0	2.0
6	商凯	中国石油大学胜利学院信息技术系	7	1	1.0	1.0