谷瘟病菌交配型基因克隆和不同地区交配型基因检测

• 作者: 任世龙 全建章 李志勇 杨振立 王永芳 白辉 董志平 邢继红
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 谷瘟病菌 交配型 PCR检测
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 56-62
• 页数: 7页
• 分类号: Q93|S432.1
• 字数: 4843字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.03.010

摘要

为明确我国谷子产区谷瘟病菌交配型基因及其分布情况对谷瘟病菌群体结构分析的重要意义.根据已知稻瘟病菌交配型基因MAT1-1-1(GenBank登录号AB080672.2)和MAT1-2-1(GenBank登录号AB080673.2)的部分序列设计3对特异性引物,利用PCR技术对186株谷瘟病菌交配型基因进行扩增检测,比对分析谷瘟病菌和稻瘟病菌的交配型基因MAT1-1-1的alpha盒子部分氨基酸序列和MAT1-2-1高迁移率蛋白盒子氨基酸序列.结果显示,引物JPX1-1-S3/JPX1-1-A3对谷瘟病菌交配型基因MAT1-1-1的扩增效果较好,而JPX1-2-S1/JPX1-2-A1对谷瘟病菌交配型基因MAT1-2-1的扩增效果较好.序列比对发现谷瘟病菌与稻瘟病菌交配型基因极为相似,但并不完全相同.对2010-2016年采自河北、山东、山西、陕西、吉林、黑龙江、辽宁、内蒙古、新疆和海南等采集地点的共186株谷瘟病菌单胞菌株的交配型基因进行检测,发现夏谷区交配型为MAT1-1的谷瘟病菌占69.15％,而交配型为MAT1-2的菌株仅占26.60％,其余4.25％菌株为双交配型菌株.春谷区交配型为MAT1-1的谷瘟病菌占38.55％,而交配型为MAT1-2的菌株仅占56.63％,其余4.82％菌株为双交配型菌株.建立了谷瘟病菌交配型基因PCR检测体系,通过该方法检测多数谷子种植区存在MAT1-1与MAT1-22种交配型的谷瘟病菌菌株,且总体上2种交配型菌株比例接近1:1.但不同地区交配型菌株所占比例有一定差异,并且自然界中存在谷瘟病菌两性菌株.快速检测谷瘟病菌的交配型等位基因和不同区域谷瘟病菌交配型基因分布对研究谷瘟病菌群体结构与遗传分析具有重要意义.