鸡粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 于航 刘颖 平文祥 葛菁萍 赵思思 高冬妮
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 物理学
• 关键词: GM-CSF 生物信息学 结构预测 基因克隆
• 年，卷（期）: 2018,（36）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 42-48
• 页数: 7页
• 分类号: O436
• 语种: 中文

摘要

为了解GM-CSF的基因及蛋白质特性,本研究以pUC-GM-CSF为模板,根据GenBank中登录的GM-CSF序列设计引物扩增GM-CSF基因,随后将其克隆至pMD 18-T载体,并对鉴定正确的重组质粒pT-GM-CSF进行测序分析,然后对GM-CSF基因进行同源性分析、ORF分析、氨基酸序列分析、疏水性分析、磷酸化位点预测、亚细胞定位分析及二级结构预测.结果表明:该基因ORF的全部长度为453bp,能够编码150个氨基酸,并且在GM-CSF基因所编码的蛋白质中有4个丝氨酸和3个苏氨酸可能成为蛋白激酶磷酸化的位点.同时,GM-CSF蛋白的最大疏水性为2.267,且有8.91％的可能位于细胞外,有0.8％的可能位于细胞壁,有0.24％的可能位于细胞质.同时,该蛋白质的二级结构主要由无规卷曲、α螺旋和延伸链构成.本研究通过对GM-CSF基因进行生物信息学分析,为探究其免疫增强机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	平文祥	黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室	88	1277	20.0	32.0
2	葛菁萍	黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室	86	718	16.0	23.0
3	刘颖	黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室	16	50	4.0	6.0
4	高冬妮	黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室	9	16	3.0	4.0
5	于航	黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室	16	9	2.0	3.0
6	赵思思	黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室	1	0	0.0	0.0