菌株Shigella flexneri FB5响应氟磺胺草醚蛋白质组学分析

• 作者: 付海燕 刘春光 来洋 杨峰山 王友超 王娅丽 黄英泽
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 氟磺胺草醚 Shigella flexneri 双向电泳 PCR扩增
• 年，卷（期）: 2018,（23）
• 所属期刊栏目: 植物保护·农药
• 页码范围: 110-116
• 页数: 7页
• 分类号: S859.84
• 字数: 5529字
• 语种: 中文

摘要

为明确氟磺胺草醚降解菌的蛋白质组学相关机理,针对实验室前期筛选得到的高效降解菌Shigella flexneri FB5,在明确菌株对氟磺胺草醚高效降解的基础上,研究进行了蛋白提取和双向电泳试验.结果发现氟磺胺草醚诱导下菌株差异蛋白点13个,使用质谱技术对它们进行鉴定.通过生物信息学比对得到其功能,并对目标蛋白的基因进行PCR扩增与测序.结果表明:研究得到氟磺胺草醚诱导下菌株两个相关基因,测序后发现基因F3序列与E.coli结合蛋白dps基因同源性是100％,基因F6序列与沙门氏菌肠溶亚种血清变型索菲亚菌S1635外膜蛋白基因和E.coli SYW004外膜蛋白基因A相似度是87％,同时对这两个基因所在家族功能进行分析,并且推测出基因的理化性质.