2株PEDV贵州分离株M基因的克隆及相似性分析

• 作者: 叶丽 曾智勇 杨伟 汤德元 王彬 石远菊 胡玲玲 黄涛 龙冬梅
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 贵州省 猪流行腹泻病毒 M基因 克隆 相似性 分析
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 兽医科学
• 页码范围: 101-104
• 页数: 4页
• 分类号: S852.65+9.6|Q785
• 语种: 中文
• DOI: 10.13881/j.cnki.hljxmsy.2017.08.0089

摘要

为了解贵州省猪流行性腹泻病毒(PEDV)分离株M基因的变异及分子进化情况,试验采用RT-PCR扩增、目的基因克隆与测序及生物信息学软件对贵州省分离的PEDV-GZAS株和PEDV-GZHZ株M基因进行序列分析.结果表明:经RT-PCR扩增,得到的片段大小为695 bp;测序结果证实,贵州分离株M基因核苷酸序列大小为695 bp;贵州分离株PEDV-GZAS株与PEDV-GZHZ株之间同源性为84.2％;PEDV-GZHZ株与瑞士疫苗株(AF353511)之间的同源性为97.7％,与中国贵州(KF150217)、泰国(FJ158546)和美国(KF272920)分离株同源性最高为99.4％;贵州分离株PEDV-GZAS株与瑞士疫苗株(AF353511)之间的同源性为97.5％,与中国贵州(KF150217)、泰国(FJ158546)和美国(KF272920)分离株同源性最高为99.3％;此次分离的2株分离株都与中国河南(EU287429)分离株同源性最低为83.1％.PEDV贵州分离株PEDV-GZAS株M基因与泰国(FJ158546)分离株遗传进化关系最近,与中国河北(JF508465)分离株亲缘关系较近;PEDV-GZHZ株与PEDV-GZAS株及参考毒株之间遗传进化关系较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汤德元		256	1165	16.0	26.0
2	曾智勇		205	619	12.0	17.0
3	王彬		72	488	10.0	21.0
4	黄涛		78	187	9.0	11.0
5	胡玲玲		29	20	3.0	3.0
6	龙冬梅		27	20	3.0	3.0
7	石远菊		21	19	3.0	3.0
8	杨伟		20	25	3.0	4.0
9	叶丽		18	15	3.0	3.0