基于加权网络和局部适应度的蛋白质复合物识别算法

• 作者: 刘翠翠 孙伟
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 加权网络 适应度 蛋白质复合物识别 模块性
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 2308-2310,2327
• 页数: 4页
• 分类号: TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2018.08.017

摘要

通常在蛋白质网络中挖掘稠密子图或模块来识别其中的蛋白质复合物,限制了其应用范围和识别的准确性.针对该问题,提出了一种基于加权网络和局部适应度的蛋白质复合物识别算法.该算法综合稠密子图的密度指标和模块性定义了新的局部适应度函数,并基于边聚集系数构建加权的蛋白质网络,根据权值选择边,在加权蛋白质网络中将种子边不断聚类扩展,挖掘综合适应度最大的子图,从而识别出蛋白质复合物.在多个真实蛋白质网络中的实验表明,该算法能够有效提升蛋白质复合物识别的准确性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙伟	信息工程大学网络空间安全学院	6	30	4.0	5.0
2	刘翠翠	长沙医学院信息工程学院	28	27	3.0	3.0