基于极大团扩展的蛋白质复合物识别算法

• 作者: 刘彬彬 李敏 王建新 陈建二
• 来源期刊: 中南大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质相互作用网络 蛋白质复合物 图挖掘 极大团
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 机械工程·控制科学与工程
• 页码范围: 560-565
• 分类号: TP391.41
• 字数: 5875字
• 语种: 中文

摘要

针对蛋白质复合物识别工具CFinder容易识别出超大复合物的缺陷,提出一种基于极大团扩展的蛋白质复合物识别算法(IPC-MCE).将极大团看作蛋白质复合物的核,通过考查核的邻居顶点与核内顶点的作用概率决定邻居顶点是否属于该复合物.基于酵母蛋白质相互作用网络平台的实验结果表明:与CFinder相比,提出的IPC-MCE算法在相同条件下能够更精确地标识已知蛋白质复合物;在最优参数设置下,IPC-MCE算法标识的已知蛋白质复合物数量是CFinder标识数量的2倍多,说明IPC-MCE算法具有更强的蛋白质复合物识别能力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王建新	中南大学信息科学与工程学院	371	3185	23.0	39.0
2	陈建二	中南大学信息科学与工程学院	167	1535	20.0	30.0
3	李敏	中南大学信息科学与工程学院	116	690	14.0	20.0
4	刘彬彬	中南大学信息科学与工程学院	8	65	6.0	8.0