盐胁迫下不同品种水稻的基因表达

• 作者: 刘仁梅 孙高宝 徐辰峰 朱长保 李均乾
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 盐胁迫 差异基因表达
• 年，卷（期）: 2018,（36）
• 所属期刊栏目: 农艺·园艺
• 页码范围: 18-20,28
• 页数: 4页
• 分类号: S511|Q786
• 字数: 3484字
• 语种: 中文

摘要

[目的]初步探索水稻耐盐机制,筛选关键基因.[方法]从公共基因芯片数据库GEO(Gene Expression Omnibus)搜索有关盐胁迫下水稻基因表达的数据,利用TAC(Transcriptome Analysis Console)筛选表达差异基因,对差异基因进行GO(Gene Ontology)富集分析、信号通路富集分析.[结果]在盐胁迫下,CSR11、PL177两种耐受型水稻与IR64、VSR156两种敏感型水稻分别有3289、1934、1806、4426个基因表达.耐受型水稻中同时上调或下调的基因有288个,敏感型水稻中同时上调或下调的基因有330个.通过生物信息学研究发现,耐受型水稻盐胁迫主要影响代谢途径、次级代谢产物合成、转录因子等方面.敏感型水稻盐胁迫影响主要影响胁迫响应、激素转导、物质代谢等方面.[结论]利用生物信息学方法能有效筛选目标基因,并可为进一步研究提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐辰峰		3	5	2.0	2.0
2	刘仁梅		4	6	2.0	2.0
3	李均乾		3	1	1.0	1.0