猪流行性腹泻病毒变异毒株与传统毒株RT-PCR鉴别诊断方法的建立

• 作者: 冀梦瑶 刘静静 卢建洲 朱文龙 王岩 赵攀登 赵胜杰 邓同炜 陈益
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 S基因 RT-PCR 鉴别诊断
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 简报
• 页码范围: 94-98
• 页数: 5页
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 2715字
• 语种: 中文

摘要

为建立猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)变异毒株和传统毒株RT-PCR鉴别诊断方法,本研究根据GenBank中PEDV变异毒株(JN381492.1)和传统毒株(JN599150.1)S基因序列,设计两对特异性引物,进行反应条件优化.结果显示:建立的RT-PCR鉴别诊断方法能够特异性区分PEDV变异毒株和传统毒株,能扩增出变异毒株442 bp的目的片段,而传统毒株是270 bp的目的片段,并且与猪传染性胃肠炎病毒、猪伪狂犬病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪细小病毒、猪呼肠孤病毒、猪瘟病毒、猪脑心肌炎病毒、轮状病毒均无交叉反应;敏感性结果表明该方法能检测出变异毒株和传统毒株的底限均为4×104 copies;利用该方法对42份临床腹泻样品进行检测,PEDV阳性率为69％(29/42),变异毒株占总PEDV毒株的93.1％(27/29),传统毒株占总PEDV毒株的6.9％(2/29).该RT-PCR方法为PEDV的病原鉴别诊断和流行病学调查提供了技术手段.