箭箸豌豆品种间遗传差异的SSR分析及指纹图谱构建

• 作者: NDAYAMBAZA Boniface 刘文献 吴洪林 张正社 李昱 王彦荣 金小煜 闵学阳 韦兴燚
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 箭管豌豆 DUS测试 转录因子 SSR标记 指纹图谱 遗传差异
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 116-128
• 页数: 13页
• 字数: 6392字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11686/cyxb2018226

摘要

转录因子(transcriptionfactors,TFs)可以通过调控基因表达来调节多种生物学过程;目前随着基因组学大数据的不断开发,使得大量TFs基因家族得以鉴定,为TF-SSR标记的开发利用提供了宝贵资源.本研究基于已有的转录组数据,鉴定出箭管豌豆转录因子282个;并从中设计了208对SSR引物,筛选出35对多态性高、稳定性好和谱带清晰的引物,进一步在30个箭筈豌豆品种中共扩增到288个等位基因;平均每个标记可产生8.23个等位基因,多态性比率(PPB)均为100％,多态信息含量(PIC)范围为0.42～1.00,平均值为0.80.另外,从35对引物中筛选出具备多个品种特征谱带的核心引物6对,可将供试的30个箭筈豌豆品种完全分开.同时,基于6对核心引物构建了箭筈豌豆品种测试的指纹图谱,可为箭筈豌豆DUS(特异性、一致性、稳定性)测试、新品种保护,以及遗传背景分析提供技术依据.