变应性鼻炎甲基化基因筛选及甲基化谱的建立

• 作者: 周穗子 彭杨 詹建东 邱前辉
• 来源期刊: 临床耳鼻咽喉头颈外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 鼻炎,变应性 甲基化芯片 基因 DNA甲基化
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 鼻科疾病的诊断与治疗
• 页码范围: 23-27
• 页数: 5页
• 分类号: R765.21
• 语种: 中文
• DOI: 10.13201/j.issn.1001-1781.2019.01.006

摘要

目的:通过甲基化芯片筛选出变应性鼻炎(AR)相关基因异常甲基化位点,探究DNA甲基化与AR的关系.方法:提取19例AR患者和11例正常下鼻甲黏膜组织DNA制成illumina甲基化芯片,通过筛选差异性甲基化位点、Gene Ontology功能富集、KEGG通路富集和文献检索对所筛选的基因进行综合分析.结果:AR患者中出现的异常甲基化位点总共为94个,其中包括高甲基化位点51个(如ST7、LCE2D、ATRIP基因),低甲基化位点43个(如PIK3CG、TLR6、IL-4基因).通过Gene Ontology功能富集、KEGG通路富集分析提示DNA甲基化与AR有相关趋势,ST7、LCE2D、PIK3CG基因DNA甲基化可能与AR相关,GO分析与KEGG分析差异无统计学意义.另外结合文献,TLR6基因和IL-4基因DNA甲基化可能与AR发病相关.结论:通过高通量甲基化芯片,在AR下鼻甲组织标本中筛选出不同程度的甲基化基因,提示基因甲基化是AR发病的重要原因,其之间的关联情况仍需进一步研究.