基于转录组测序对紫花苜蓿铅胁迫相关基因的富集分析

• 作者: 徐博 王昆 王英哲 郭强
• 来源期刊: 草业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 紫花苜蓿 转录组 铅胁迫 耐铅基因
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 植物生产层
• 页码范围: 2525-2534
• 页数: 10页
• 分类号: S541+.9
• 字数: 5825字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11829/j.issn.1001-0629.2018-0675

摘要

本文采用高通量Illumina Hiseq测序平台对紫花苜蓿(Medicago sativa)的铅胁迫处理组(Pb96)和对照组(CK)进行转录组测序,并对测序数据进行分析,探究紫花苜蓿抗铅应答的分子机制.结果 表明,在铅胁迫处理下共检测到2 242个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs).其中,1 321个DEGs上调表达,921个DEGs下调表达.GO (Gene ontology,http://www.geneontology.org/)富集分析,差异表达基因主要涉及物质代谢、蛋白结合、催化活性等.KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes,http://www.genome.jp/kegg/)分析,差异基因主要涉及代谢途径、光合作用、淀粉和蔗糖代谢等.COG (Clusters of orthologous groups of proteins/orthologous groups of genes)分析,差异基因主要涉及“碳水化合物的运输和新陈代谢”、“翻译、核糖体结构和生物发生”、“次生代谢产物的生物合成、转运和分解代谢”等.本研究通过对紫花苜蓿根系转录组分析,为研究紫花苜蓿耐铅分子机制提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐博	吉林农业大学动物科学技术学院	40	120	7.0	8.0
2	郭强	吉林农业大学动物科学技术学院	5	14	3.0	3.0
3	王英哲		20	42	4.0	5.0