基于高通量测序方法分析荣成月湖潮间带趋磁细菌多样性

• 作者: 吴龙飞 张文燕 杜海舰 潘红苗 肖天 董逸 陈一然
• 来源期刊: 海洋科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 潮间带 多样性 趋磁细菌 高通量测序
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1-10
• 页数: 10页
• 分类号: Q939.99
• 字数: 6908字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11759/hykx20180925001

摘要

荣成月湖是一个典型天然潟湖,潮间带沉积物中存在多种形态趋磁细菌.通过Roche 454高通量测序平台,对沉积物样品(B_S)和磁收样品(B_M)进行16S rRNA基因高通量测序,认识荣成潮间带沉积物的细菌群落结构,并了解趋磁细菌多样性及系统进化地位.研究结果表明沉积物样品中主要的细菌类群为δ-变形菌纲,占总细菌数的26.4％,其次是γ-变形菌纲和α-变形菌纲;而磁收样品中细菌多样性和种类明显降低,以α-变形菌纲占绝对优势,相对比例达72.6％.在磁收样品和沉积物样品分别发现了1612条和186条reads与趋磁细菌相关,分别占细菌总数的5.76％和0.85％,磁收样品中趋磁细菌数是沉积物样品的6.8倍.对两个样品中获得的趋磁细菌序列进行系统进化分析,发现这些序列多数属于变形菌门的 α-变形菌纲,以趋磁球菌占绝对优势,少数属于 δ-变形菌纲,与多细胞趋磁原核生物亲缘关系最近.海洋趋磁螺菌属仅在B_M样品中检出,趋磁弧菌属在B_M样品优势度高于B_S样品,而多细胞趋磁原核生物和趋磁螺菌属在B_S样品中优势度更高.通过分析样品间的差异OTUs,认为荣成潮间带沉积物中可能存在大量未知的趋磁细菌新类群.研究结果为下一步培养和开发趋磁细菌这一功能菌群,发现趋磁细菌新类群及趋磁细菌生态功能提供了基础资料.